Биохимия: различия между версиями
imported>Zenit1984 |
imported>Alex NB OT м Проект Check Wikipedia: исправление ошибки 64 |
||
| Строка 1: | Строка 1: | ||
{{ | {{Другие значения}} | ||
'''Биохи́мия''' ('''биологи́ческая''', '''или''' '''физиологи́ческая хи́мия''', '''хими́ческая биоло́гия''') — [[наука]] о химическом составе живых [[Клетка|клеток]] и [[организм]]ов, а также о лежащих в основе их [[Жизнедеятельность|жизнедеятельности]] [[Химические процессы|химических процессах]]. Термин «биохимия» эпизодически употреблялся с середины [[XIX век]]а, в классическом смысле он был предложен и введён в научную среду в [[1903 год]]у немецким [[химик]]ом [[Нейберг, Карл|Карлом Нейбергом]]{{sfn|Vasudevan|2013|p=3}}. | |||
Биохимия — сравнительно молодая [[наука]], которая находится на [[Трансдисциплинарность|стыке]] [[Биология|биологии]] и [[Химия|химии]]{{sfn|Северин|2003|с=6}}. | |||
| | |||
}} | |||
== История развития == | |||
[[Файл:Portrait of J.B. van Helmont, Aufgang...1683 Wellcome L0003194.jpg|thumb|left|150 px| ван Гельмонт]] | |||
Как самостоятельная наука биохимия сформировалась примерно 100 лет назад, однако биохимические процессы люди использовали ещё в глубокой древности, не подозревая, разумеется, об их истинной сущности. В самые отдалённые времена уже была известна технология таких основанных на биохимических процессах производств, как [[хлебопечение]], [[сыроварение]], [[виноделие]], выделка кож. Необходимость борьбы с [[Болезнь|болезнями]] заставляла задумываться о превращениях веществ в организме, искать объяснения целебным свойствам [[Лекарственное растение|лекарственных растений]]. Использование растений в [[Пища|пищу]], для изготовления [[Краски|красок]] и [[Ткань|тканей]] также приводило к попыткам понять свойства веществ [[Растение|растительного]] происхождения. Древние мыслители рассуждали о том, какую роль играют воздух и пища в жизнеобеспечении живых существ, о том что вызывает процесс [[Брожение|брожения]]<ref>[http://kazanbiochemistry.ru/index/0-2 Зубаиров Д. М. Вехи истории первой кафедры медицинской химии и физики в России (2007)] {{Wayback|url=http://kazanbiochemistry.ru/index/0-2 |date=20141223171023 }}</ref>. | |||
Персидский [[учёный]] и [[врач]] [[X век]]а [[Авиценна]] в своей книге «[[Канон врачебной науки]]» подробно описал многие [[лекарственные вещества]]<ref>[[Авиценна]] «[[Канон врачебной науки]]» [http://www.bibliotekar.ru/ibn/index.htm] {{Wayback|url=http://www.bibliotekar.ru/ibn/index.htm|date=20130524005643}}</ref>. | |||
{{ | |||
=== | В XVII веке [[Гельмонт, Ян Баптиста ван|ван Гельмонт]] ввёл в обиход термин [[Ферменты|фермент]] для обозначения [[химические реактивы|химического реагента]] участвующего в процессе [[пищеварение|пищеварения]]<ref>{{книга|автор =Harré, R. | заглавие = Great Scientific Experiments | издательство=Oxford University Press | год=1983 | место=Oxford | страницы = 33—35 | язык=en }}</ref>. | ||
[[XVIII век]] ознаменовался трудами [[Ломоносов, Михаил Васильевич|М. В. Ломоносова]] и [[Лавуазье|А. Л. Лавуазье]]. На основе открытого ими [[Закон сохранения массы веществ|закона сохранения массы веществ]] и накопленных к концу столетия экспериментальных данных, была объяснена сущность [[Дыхание|дыхания]] и исключительная роль в этом процессе [[кислород]]а{{sfn|Березов|1998|p=16}}. | |||
[[Файл:Prout William painting.jpg|thumb|right|150px|Портрет Уильяма Праута работы Генри Виндхама Филипса]] | |||
Изучение химии жизни уже в 1827 г. привело к принятому до сих пор разделению биологических молекул на [[белки]], [[жир]]ы и [[углеводы]]. Автором этой классификации был английский химик и врач [[Праут, Уильям|Уильям Праут]]<ref>[http://jn.nutrition.org/cgi/reprint/107/1/15.pdf William Prout]</ref>. В [[1828 год]]у немецкий химик [[Вёлер, Фридрих|Ф. Вёлер]] [[Химический синтез|синтезировал]] [[Мочевина|мочевину]]: сначала — из [[Циановая кислота|циановой кислоты]] и [[аммиак]]а (выпариванием [[раствор]]а образующегося цианата аммония), а позже в этом же году — из [[Углекислый газ|углекислого газа]] и [[аммиак]]а. Тем самым впервые было доказано, что химические вещества живого организма могут быть синтезированы искусственно, вне организма. Работы [[Вёлер, Фридрих|Вёлера]] нанесли первый удар по теориям представителей школы [[Витализм|виталистов]], предполагавших присутствие во всех [[Органические соединения|органических соединениях]] некой «жизненной силы»{{sfn|Березов|1998|p=16}}. Последующими мощными толчками в этом направлении химии явились лабораторные синтезы [[липид]]ов (в [[1854 год]]у — [[Бертло, Марселен|М. Бертло]], [[Франция]]) и [[углевод]]ов из [[формальдегид]]а ([[1861]] — [[Бутлеров, Александр Михайлович|А. М. Бутлеров]], [[Россия]]). Бутлеровым была также разработана [[теория химического строения|теория строения]] органических соединений<ref>{{статья|автор=Бутлеров А.|заглавие=О химическом строении веществ|издание=[[Учёные записки Казанского университета]] (отд. физ.-мат. и мед. наук). Вып.1, отд.1|год=1862|страницы=1—11}}</ref>. | |||
= | Новый толчок развитию биологической химии дали работы по изучению брожения, инициированные [[Пастер, Луи|Луи Пастером]]. В 1897 г. [[Бухнер, Эдуард|Эдуард Бухнер]] доказал, что ферментация сахара может происходить в присутствии бесклеточного дрожжевого экстракта, и это процесс не столько биологический, сколько химический{{sfn|Березов|1998|p=17}}. На рубеже [[XIX век|XIX]] и [[XX век]]ов немецкий биохимик [[Фишер, Герман Эмиль|Э. Фишер]] сформулировал основные положения пептидной теории строения белков, установил структуру и свойства почти всех входящих в их состав [[Аминокислоты|аминокислот]]. Но лишь в 1926 г. [[Самнер, Джеймс Бетчеллер|Джеймсу Самнеру]] удалось получить первый чистый фермент, [[Уреаза|уреазу]], и доказать, что фермент — это белок<ref>{{Cite web |url=http://www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1946/sumner-bio.html |title=The Nobel Prize in Chemistry 1946 |access-date=2014-11-17 |archive-date=2018-06-23 |archive-url=https://web.archive.org/web/20180623194016/https://www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1946/sumner-bio.html |url-status=live }}</ref>. | ||
==== | Биохимия стала первой биологической дисциплиной с развитым математическим аппаратом благодаря работам [[Холдейн, Джон Скотт|Холдейна]], [[Михаэлис, Леонор|Михаэлиса]], [[Ментен, Мод Леонора|Ментен]] и других биохимиков, создавших ферментативную [[химическая кинетика|кинетику]], основным законом которой является [[уравнение Михаэлиса-Ментен]]<ref name="chen10">{{статья |заглавие=Classic and contemporary approaches to modeling biochemical reactions |издание=[[Genes & Development|Genes Dev]] |том=24 |страницы=1861—1875 |doi=10.1101/gad.1945410 |pmid=20810646 |номер=17 |pmc=2932968 |язык=en |тип=journal |автор=Chen, W.W., Neipel, M., Sorger, P.K. |год=2010}}</ref>. | ||
==== | В 1928 г [[Фредерик Гриффит]] впервые показал, что [[экстракт]] убитых нагреванием болезнетворных бактерий может передавать признак патогенности не опасным [[Бактерии|бактериям]]. Исследование [[трансформация (генетика)|трансформации]] бактерий в дальнейшем привело к очистке болезнетворного агента, которым, вопреки ожиданиям, оказался не белок, а [[нуклеиновая кислота]]. Сама по себе [[нуклеиновая кислота]] не опасна, она лишь переносит [[ген]]ы, определяющие [[патогенность]] и другие свойства [[Микроорганизмы|микроорганизма]]. В [[1953 год]]у американский биолог [[Уотсон, Джеймс|Дж. Уотсон]] и английский физик [[Крик, Фрэнсис|Ф. Крик]] опираясь на работы [[Уилкинс, Морис|М. Уилкинса]] и [[Франклин, Розалинд|Р. Франклин]] [[Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid|описали]] структуру [[Дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]] — ключ к пониманию принципов передачи [[Наследственная информация|наследственной информации]]. Это открытие означало рождение нового направления науки — [[Молекулярная биология|молекулярной биологии]]<ref>{{статья |заглавие=General nature of the genetic code for proteins |издание=Nature |том=192 |страницы=1227—1232 |pmid=13882203 |doi=10.1038/1921227a0 |ссылка=http://profiles.nlm.nih.gov/SC/B/C/B/J/_/scbcbj.pdf |язык=en |автор=Crick F. H., Barnett L., Brenner S., Watts-Tobin R. J. |месяц=12 |год=1961 |archive-date=2016-03-03 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160303194547/http://profiles.nlm.nih.gov/SC/B/C/B/J/_/scbcbj.pdf }}</ref>. | ||
==== | В 1958 [[Бидл, Джордж Уэлс|Джордж Бидл]] и [[Тейтем, Эдуард|Эдуард Тейтем]] получили [[Нобелевская премия|Нобелевскую премию]] за работу проведённую на грибах, выводом которой стала гипотеза ''«один ген — один фермент»''<ref>{{статья|ссылка=http://www.pnas.org/content/27/11/499.short|автор=Beadle G. W., Tatum E. L.|заглавие=Genetic Control of Biochemical Reactions in Neurospora|год=1941|язык=en|издание=[[Proceedings of the National Academy of Sciences|Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America]]|тип=journal|месяц=11|число=15|том=27|номер=11|страницы=499—506|doi=10.1073/pnas.27.11.499|pmid=16588492|pmc=1078370|archive-url=https://web.archive.org/web/20150924163320/http://www.pnas.org/content/27/11/499.short|archive-date=2015-09-24}}[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1078370/pdf/pnas01634-0009.pdf] {{Wayback|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1078370/pdf/pnas01634-0009.pdf|date=20220120070631}}</ref>. В 1988 [[Питчфорк, Колин|Колин Питчфорк]] стал первым человеком, осуждённым за убийство на основе доказательств, полученных в результате [[ДНК-дактилоскопия|ДНК-дактилоскопии]] доказательств, и первым преступником, пойманным в результате массового применения процедуры дактилоскопии<ref name="Butler 2009">{{книга |заглавие=Fundamentals of Forensic DNA Typing |ссылка=https://books.google.com/books?id=-OZeEmqzE4oC&pg=PA5 |год=2009 |издательство=[[Academic Press]] |isbn=978-0-08-096176-7 |страницы=5 |язык=en |автор=Butler, John M.}}</ref>. Из последних вех в развитии биохимии следует отметить получение [[Файер, Эндрю|Эндрю Файером]] и [[Крейг Мелло|Крейгом Мелло]] [[Нобелевская премия по физиологии и медицине|Нобелевской премии по физиологии и медицине]] за «открытие [[Рибонуклеиновая кислота|РНК]]-интерференции — эффекта гашения активности определённых [[ген]]ов»<ref>Andrew Fire, Siqun Xu, Mary K. Montgomery, Steven A. Kostas, Samuel E. Driver und [[Craig C. Mello]]: ''Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans''. In: ''Nature.'' Band 391, 1998, S. 806—811, PMID 9486653 [http://www.umassmed.edu/administration/uploads/Fire_and_Mello_Nature_1998.pdf PDF] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20060112172846/http://www.umassmed.edu/administration/uploads/Fire_and_Mello_Nature_1998.pdf|date=2006-01-12}}</ref><ref name="Sen 2007">{{статья |заглавие=miRNA: Licensed to kill the messenger |издание=DNA Cell Biology |том=26 |номер=4 |страницы=193—194 |pmid=17465885 |doi=10.1089/dna.2006.0567 |язык=en |автор=Sen, Chandan K.; Roy, Sashwati |год=2007}}</ref>, а также технология редактирования генома с помощью Crisp/Cas9 метода. | ||
== | == Смежные дисциплины == | ||
{{ | Возникнув как наука о химии жизни в конце XIX века{{sfn|Северин|2003|с=6}}, чему предшествовало бурное развитие [[Органическая химия|органической химии]], биохимия отличается от органической химии тем, что исследует только те вещества и химические реакции, которые имеют место в живых организмах, прежде всего в живой клетке. Согласно этому определению, биохимия охватывает также многие области [[Клеточная биология|клеточной биологии]] и включает в себя [[Молекулярная биология|молекулярную биологию]]<ref>''Р. Марри'' и др. Биохимия человека. Т. 1. — М., 1993. — с. 10.</ref>. После выделения последней в особую дисциплину, размежевание между биохимией и молекулярной биологией в основном сформировалось как методологическое и по предмету исследования. Молекулярные биологи преимущественно работают с [[Нуклеиновые кислоты|нуклеиновыми кислотами]], изучая их структуру и функции, в то время как биохимики сосредоточились на [[Белки|белках]], в особенности на [[Ферменты|ферментах]], катализирующих биохимические реакции. В последние годы термины «биохимия» и «молекулярная биология» часто используются как синонимы{{sfn|Березов|1998|p=17}}. | ||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
}} | |||
=== | == Разделы биохимии == | ||
* '''Статическая биохимия''' ('''[[Биоорганическая химия]]''') — наука о химическом составе организмов и структур составляющих их молекул (белков, аминокислот, нуклеиновых кислот, нуклеотидов, углеводов и их производных, липидов, витаминов, гормонов). Её основные объекты — [[биополимер]]ы, превращения которых составляют химическую сущность биологических процессов, и [[биорегулятор]]ы, которые химически регулируют обмен веществ. | |||
** '''Биохимия аминокислот''' — наука о химическом составе аминокислот<ref>Майстер А. Биохимия аминокислот : [монография] / Под ред. и с предисл.: А. Е. Браунштейн; пер. с англ.: Г. Я. Виленкина — М.: Иностр. лит., 1961 . — 530 с.</ref>. | |||
** '''Биохимия белков''' — наука о химическом составе белков<ref>Синютина С. Е. Биохимия белков и ферментов. — Тамбов: ТГУ им. Г. Р. Державина, 2010.</ref>. | |||
** '''Биохимия ферментов''' — наука о химическом составе ферментов<ref>Химия и биохимия ферментов: [Сб. статей]. — К.: Наук. думка, 1981. — 90 с.: ил.; 26 см. — (Биохимия животных и человека : Респ. межвед. сб. / АН УССР, Ин-т биохимии им. А. В. Палладина; Вып. 5).</ref>. | |||
** '''Биохимия углеводов''' — наука о химическом составе углеводов<ref>Химия и биохимия углеводов: Учеб. пособие. — Владивосток : Изд-во ДВГАЭУ, 1999. — 56 с.</ref>. | |||
** '''Биохимия нуклеиновых кислот''' — наука о химическом составе нуклеиновых кислот<ref>Дэвидсон Дж. Биохимия нуклеиновых кислот / Пер. с англ. к. ф.-м. н. В. В. Борисова; Под ред. и с предисл. А. А. Баева. — М.: Мир, 1976. — 412 с.</ref><ref>Терентьева Н. А. Химия и биохимия нуклеиновых кислот: учебное пособие. — Владивосток: Дальнаука, 2011. — 268 с.</ref>. | |||
** '''Биохимия нуклеотидов''' — наука о химическом составе нуклеотидов<ref>Степаненко Б.Н. Химия и биохимия углеводов (полисахариды): Учеб. пособие для вузов. — М.: Высш. Школа, 1978. — 256 с.</ref><ref>Соболев А. С. Радиационная биохимия циклических нуклеотидов. — М.: Энергоатомиздат, 1987. — 100 с.</ref>. | |||
** '''Биохимия липидов''' — наука о действии липидов, их биологических эффектах, биохимических нарушениях при недостатке или избытке в организме<ref>Препаративная биохимия липидов / [Л. Д. Бергельсон, Э. В. Дятловицкая, Ю. Г. Молотковский и др.; Отв. ред. Л. Д. Бергельсон, Э. В. Дятловицкая]. — М.: Наука, 1981. — 259 с.</ref>. | |||
** '''Биохимия витаминов''' — наука о действии витаминов, их биологических эффектах, биохимических нарушениях при недостатке или избытке в организме<ref>Иваненко Е. Ф. Биохимия витаминов: [Учеб. пособие для биол. специальностей вузов]. — К.: Вища школа, 1970. — 210 с.</ref><ref>Биохимия витаминов : учебно-методическое пособие для студентов / А. И. Конопля, Н. А. Быстрова. Курск: КГМУ, 2012.</ref>. | |||
** '''Биохимия гормонов''' — наука о действии гормонов, их биологических эффектах, биохимических нарушениях при недостатке или избытке в организме<ref>Биохимия гормонов и гормональной регуляции: монография / [С. А. Афиногенова, А. А. Булатов, В. Н. Гончарова и др.; Отв. ред. акад. Н. А. Юдаев]. — М.: Наука, 1976. — 379 с.</ref><ref>Шушкевич Н. И. Биохимия гормонов : учебное пособие по медицинской биохимии. — Владимир: Изд-во ВлГУ, 2009. — 67 с.</ref>. | |||
* '''Динамическая биохимия''' — изучает химические реакции, представляющие обмен веществ (метаболизм), а именно пути превращения молекул и механизмы происходящих между ними реакций<ref>Гофман Э. Г. Динамическая биохимия / Пер. с нем. канд. мед. наук А. И. Арчакова и канд. мед. наук В. М. Девиченского; Под ред. и с предисл. д-ра мед. наук проф. Л. Ф. Панченко. — М.: Медицина, 1971. — 311 с.</ref><ref>Динамическая биохимия: учебное пособие / [В. Е. Толпекин и др.]. — М.: Изд-во МАИ-Принт, 2011. — 71 с.</ref>. | |||
** '''[[Молекулярная биология]]''' — наука, ставящая своей задачей познание природы явлений жизнедеятельности путём изучения биологических объектов и систем на уровне, приближающемся к молекулярному, а в ряде случаев и достигающем этого предела. | |||
** '''[[Биоэнергетика (наука)|Биоэнергетика]]''' — раздел динамической биохимии, который изучает закономерности образования, аккумуляции и потребления энергии в биологических системах. | |||
* '''Функциональная биохимия''' — раздел биохимии, изучающий химические превращения, лежащие в основе функций органов, тканей и организма в целом<ref>Гомазков О. А. Функциональная биохимия регуляторных пептидов: монография. — М.: Наука, 1992. — 159, [1] с.</ref>. | |||
**'''Биохимия микроорганизмов''' ('''Биохимия бактерий''') — наука о составе и превращениях веществ в микроорганизмах<ref>Неверова О. А. Биохимия микроорганизмов: учебное пособие: для студентов вузов / О. А. Неверова; Федер. агентство по образованию, Кемер. технол. ин-т пищевой пром-ти. — Кемерово: КемТИПП, 2005. — 83 с.</ref>. | |||
** '''[[Биохимия растений]]''' — наука о молекулярных процессах, происходящие в растительном организме <ref>Клетович В. Л. Биохимия растений: Учебник. 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Высшая школа, 1986. — 503 с.</ref><ref>{{Cite web |url=http://files.lbz.ru/pdf/cC1302-0-ch.pdf |title=Биохимия растений / Г.-В. Хелдт; пер. с англ. — 2-е изд. (эл.). — М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2014. — 471 с.: ил. — (Лучший зарубежный учебник) |access-date=2017-07-16 |archive-date=2017-12-10 |archive-url=https://web.archive.org/web/20171210071601/http://files.lbz.ru/pdf/cC1302-0-ch.pdf |url-status=live }}</ref>. | |||
** '''Биохимия животных''' — наука о молекулярных процессах, протекающих в клетках живых организмов<ref>Рогожин В. В. Биохимия животных: Учебник. — СПб.: ГИОРД, 2009. — 552 с: ил. ISBN 978-5-98879-074-7</ref>. | |||
** '''Биохимия человека''' — это раздел биохимии, который изучает закономерности обмена веществ в человеческом организме<ref>Биохимия человека: [Учеб.]: В 2 тт. / Р. Марри, Д. Греннер, П. Мейес, В. Родуэлл; Пер. с англ. к. ф.-м. н. В. В. Борисова и Е. В. Дайниченко Под ред. д. х. н. Л. М. Гинодмана. — М. : Мир, 2004.</ref>. | |||
***'''Биохимия крови''' — наука о закономерностях обмена веществ в крови человека<ref>Наточин Ю. В. Биохимия крови и диагностика / Клинич. б-ца РАМН. — СПб. : Б. и., 1993. — 149 с.</ref><ref>Барышева Е. С. Биохимия крови : лабораторный практикум/ Барышева Е. С., Бурова К. М. — Электрон. текстовые данные. — Оренбург: Оренбургский государственный университет, ЭБС АСВ, 2013. — 141 c.</ref>. | |||
*** '''Биохимия тканей''' — наука о закономерностях обмена веществ в тканях человека<ref>Языкова М. Ю. Биохимия тканей: учебное пособие для студентов, обучающихся по биологическим специальностям / М. Ю. Языкова. — Самара: Самарский университет, 2004. — 75 с.</ref>. | |||
*** '''Биохимия органов''' — наука о закономерностях обмена веществ в органах человека. | |||
*** '''[[Медицинская биохимия]]''' — это раздел биохимии, который изучает закономерности обмена веществ в человеческом организме при заболеваниях<ref>Солвей Дж. Г. Наглядная медицинская биохимия: [учеб. пособие] / пер. с англ. А. П. Вабищевич, О. Г. Терещенко; под ред. Е. С. Северина. — 3-е изд., перераб. и доп. — М.: ГЭОТАР-Медиа, 2015. — 168 с. ISBN 978-5-9704-2037-9</ref>. | |||
*** '''Биохимия мышечной деятельности''' — это раздел биохимии, который изучает закономерности обмена веществ в человеческом организме при мышечной деятельности<ref>Калинский М. И. Биохимия мышечной деятельности. — К.: Здоровья, 1989. — 143 с.</ref><ref>Биохимия мышечной деятельности: Учеб. для студентов вузов физ. воспитания и спорта / Н. И. Волков, Э. Н. Несен, А. А. Осипенко, С. Н. Корсун. — К.: Олимп. лит., 2000. — 502,[1] с.</ref><ref>Мохан Р. Биохимия мышечной деятельности и физической тренировки / Рон Мохан, Майкл Глессон, Пауль Л. Гринхафф; [Пер. с англ. Валерий Смульский]. — К.: Олимп. лит., 2001. — 295 с.</ref>. | |||
**** '''Биохимия спорта''' — наука, выявляющая закономерности обмена веществ в человеческом организме при предельной по объёму и/или интенсивности мышечной деятельности<ref>Яковлев Н. Н. Биохимия спорта. — М.: Физкультура и спорт, 1974. — 288 с.</ref><ref>Михайлов С. С. Спортивная биохимия: учебник / С. С. Михайлов. — 6-е изд., стер. — М.: Советский спорт, 2010. — 347 с.</ref><ref>Михайлов С. С. Биохимия двигательной деятельности: учебник / С. С. Михайлов. — М.: Спорт, 2016. — 292 с.</ref>. | |||
== | == Методы изучения == | ||
В основе биохимической методологии лежит фракционирование, анализ, изучение структуры и свойств отдельных компонентов живого вещества. Методы биохимии преимущественно формировались в XX веке; наиболее распространёнными являются [[хроматография]], открытая [[Михаил Цвет|М. С. Цветом]] 21 марта 1903 г.{{sfn|Березов|1998|p=26}}, [[центрифугирование]] ([[Сведберг, Теодор|Т. Сведберг]], 1923 г., [[Нобелевская премия по химии]] 1926 г.) и [[электрофорез]] ([[Тизелиус, Арне|А. Тизелиус]], 1937 г., Нобелевская премия по химии 1948 г.){{sfn|Березов|1998|p=30-32}}<ref name="Laberge" />. Важным экспериментальным способом, позволяющим на атомарном уровне установить трехмерную структуру белка, является рентгеноструктурный, или кристаллографический, анализ, позволяющий определить пространственные координаты всех атомов исследуемого объекта. Впервые он был применен Джоном Кендрью и Максом Перутцом для исследования гемоглобина и миоглобина<ref>{{cite pmid|18990801}}</ref><ref>{{cite pmid|18990802}}</ref>. Розалинд Франклин, успешная ученая-рентгенограф, совершенствовавшая технику микросъемки и добившаяся удивительных по четкости рентгенограмм молекул, способствовала открытию двойной спирали ДНК Джеймсом Уотсоном и Фрэнсисом Криком<ref>{{статья |заглавие=[[Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid]] |издание=Nature |том=171 |номер=4356 |страницы=737—738 |pmid=13054692 |doi=10.1038/171737a0 |bibcode=1953Natur.171..737W |язык=en |автор=Watson J. D., Crick F. H. |год=1953 }}</ref>. | |||
С конца XX в. в биохимии всё шире применяются методы [[молекулярная биология|молекулярной]] и [[клеточная биология|клеточной]] биологии, в особенности искусственная [[Экспрессия генов|экспрессия]] и нокаут [[ген]]ов в модельных клетках и целых организмах (см. [[генная инженерия]], [[биотехнология]]). Определение структуры всей [[геном]]ной ДНК человека выявило приблизительно столько же ранее неизвестных генов и их неизученных продуктов, сколько уже было известно к началу XXI века благодаря полувековым усилиям научного сообщества. Оказалось, что традиционный химический анализ и очистка ферментов из [[Биомасса|биомассы]] позволяют получить лишь те белки, которые в биогенных веществах присутствуют в сравнительно большом количестве. Не случайно основная масса ферментов была открыта биохимиками в середине XX века и к концу столетия распространилось убеждение, что все ферменты уже открыты. Данные [[геномика|геномики]] опровергли эти представления, но дальнейшее развитие биохимии требовало изменения методологии. [[Генная инженерия|Искусственая экспрессия]] ранее неизвестных генов предоставила биохимикам новый материал для исследования, часто недоступный традиционными методами. В результате возник новый подход к планированию биохимического исследования, который получил название '''[[обратная генетика]]''' или '''функциональная геномика'''<ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?highlight=genomics,functional&rid=sef.section.541 Koonin E., Galperin M. Sequence — Evolution — Function.]</ref>. В последние десятилетия большое развитие произошло в области [[Компьютерное моделирование|компьютерного моделирования]]. Эта методика позволяет исследовать свойства [[Биомолекулы|биомолекул]] там, где невозможно (или очень затруднительно) провести прямой эксперимент. Методика основана на компьютерных программах, которые позволяют визуализировать структуру биомолекул, задать их предполагаемые свойства и наблюдать результирующие взаимодействия между молекулами, такие например как [[энзим]] — [[Субстрат (биохимия)|субстрат]], энзим — [[коэнзим]], энзим — [[ингибитор]]<ref name = "Laberge">{{книга |автор=Monique Laberge |заглавие=Biochemistry |ответственный= |ссылка=https://books.google.co.il/books?id=KxYiOVaqTk4C&printsec=frontcover&dq=Biochemistry&hl=iw&sa=X&ei=MzGrUer0H4bWswaluYHQBg&ved=0CDcQ6AEwAQ |место=USA |издательство=Infobase Publishing |год=2008 |том= |страниц=112 |страницы=4 |isbn=97807910196932}}</ref>. | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
| | |||
}} | |||
=== | == Необходимые химические элементы == | ||
{{Основная статья|Биологически значимые элементы}} | |||
Из 90 химических элементов, встречающихся в естественном состоянии в природе, для поддержания жизни необходимо чуть больше четверти. Большинство редких элементов не являются необходимыми для поддержания жизни (исключениями являются [[селен]] и [[иод]]). Большинством живых организмов не используются также два распространённых элемента, [[алюминий]] и [[Титан (элемент)|титан]]. Списки необходимых для живых организмов элементов различаются на уровне высших таксонов. Всем животным необходим [[натрий]], но некоторые растения обходятся без него. Растениям необходим [[Бор (элемент)|бор]] и [[кремний]], а животным — нет (или необходим в ультрамикроскопических количествах). Всего шесть элементов (так называемые ''макронутриенты'', или ''органогенные элементы'') составляют до 99% от массы человеческого организма. Это [[углерод]], [[водород]], [[азот]], [[кислород]], [[кальций]] и [[фосфор]]. Кроме этих шести основных элементов, человеку необходимы малые или микроскопические количества ещё 19 элементов: [[натрий]], [[хлор]], [[калий]], [[магний]], [[сера]], [[железо]], [[фтор]], [[цинк]], [[кремний]], [[медь]], [[иод]], [[Бор (элемент)|бор]], [[селен]], [[никель]], [[хром]], [[марганец]], [[молибден]], [[кобальт]]<ref>Ultratrace minerals. | |||
Authors: Nielsen, Forrest H. USDA, ARS Source: Modern nutrition in health and disease / editors, Maurice E. Shils … et al.. Baltimore : Williams & Wilkins, c1999., p. 283-303. Issue Date: 1999 URI: [http://hdl.handle.net/10113/46493] {{Wayback|url=http://hdl.handle.net/10113/46493|date=20200316042145}}</ref> и, как показано в 2014 году, [[бром]]<ref name="pmid24906154">{{статья |заглавие=Bromine Is an Essential Trace Element for Assembly of Collagen IV Scaffolds in Tissue Development and Architecture |издание=[[Cell (журнал)|Cell]] |том=157 |номер=6 |страницы=1380—1392 |pmid=24906154 |doi=10.1016/j.cell.2014.05.009 |язык=en |тип=journal |автор=McCall A. S., Cummings C. F., Bhave G., Vanacore R., Page-McCaw A., Hudson B. G. |год=2014 |издательство=[[Cell Press]] }}</ref>. | |||
< | == Биомолекулы == | ||
{{ | Четыре основных типа молекул, исследованием которых занимается биохимия — это [[углеводы]], [[липиды]], [[белки]] и [[нуклеиновые кислоты]], а также их [[гибрид]]ы, [[протеогликаны]], [[гликопротеины]], [[липопротеины]] и т. п. Многие биомолекулы являются [[полимер]]ами ([[макромолекула]]ми), строительными «блоками» которых являются более простые биомолекулы. Например, [[полисахариды]] состоят из простых сахаров, белки из [[аминокислоты|аминокислот]], нуклеиновые кислоты из мононуклеотидов. Биологические полимеры часто составляют комплексы, строение которых неразрывно связано с их биологической функцией<ref name = "Laberge2">{{книга |автор=Monique Laberge |заглавие=Biochemistry |ответственный= |https://books.google.co.il/books?id=KxYiOVaqTk4C&printsec=frontcover&dq=Biochemistry&hl=iw&sa=X&ei=MzGrUer0H4bWswaluYHQBg&ved=0CDcQ6AEwAQ#v=onepage&q=Biochemistry&f=false|место=USA |издательство=Infobase Publishing |год=2008 |том= |страниц=112 |страницы=2 |isbn=97807910196932}}</ref>. В иерархии химической сложности живых систем макромолекулы стоят выше химических элементов, [[Функциональная группа|функциональных групп]] и простых биомолекул, а на следующих ступенях этой иерархии — [[Обмен веществ|метаболические пути]], [[клетка]], многоклеточные [[организм]]ы и [[Экосистема|экосистемы]]<ref>Новая медицинская энциклопедия [https://posohov.ru/wiki/Биохимия Биохимия] {{Wayback|url=https://posohov.ru/wiki/%D0%91%D0%B8%D0%BE%D1%85%D0%B8%D0%BC%D0%B8%D1%8F |date=20210716155029 }}</ref>. | ||
{{ | |||
= {{- | === Углеводы === | ||
{{Основная статья|Углеводы}} | |||
[[Файл:Sucrose structure formula inkscape.svg|thumbnail|185px|Молекула [[сахароза|сахарозы]] (глюкоза + фруктоза), пример [[дисахариды|дисахарида]]]] | |||
Простые углеводы или [[моносахариды]], как например [[глюкоза]] (C<sub>6</sub>H<sub>12</sub>O<sub>6</sub>), [[фруктоза]] (C<sub>6</sub>H<sub>12</sub>O<sub>6</sub>)<ref name=Whiting1970>{{книга |год=1970 |часть=Sugars |заглавие=The Biochemistry of Fruits and their Products |страницы=1—31 |том=Volume 1 |место=London & New York |издательство=[[Academic Press]] |язык=en |автор=Whiting, G.C |ответственный=A.C. Hulme}}</ref>, и [[дезоксирибоза]] (C<sub>5</sub>H<sub>10</sub>O<sub>4</sub>) могут служить [[мономер]]ами более сложных. Так во время синтеза молекулы дисахарида соединяются две молекулы моносахаридов и выделяется молекула воды. Полисахариды служат для аккумуляции энергии ([[крахмал]] у растений, [[гликоген]] у животных), а также как структурообразующие молекулы (например основным компонентом [[Клеточная стенка|клеточных стенок]] растений является полисахарид [[целлюлоза]], а [[хитин]] является структурным полисахаридом низших растений, грибов и [[Беспозвоночные|беспозвоночных животных]] (в основном роговых оболочек [[Членистоногие|членистоногих]] — насекомых и ракообразных)<ref name="Бауков">{{книга|автор = Н. А. Тюкавкина, Ю. И. Бауков|часть = |заглавие = Биоорганическая химия|ссылка = |ответственный = |издание = 1-е изд|место = М.|издательство = Медицина|год = 1985|том =|страницы = 349—400|страниц = 480|серия = Учебная литература для студентов медицинских институтов|isbn =|тираж = 75000}}</ref>. | |||
=== | === Липиды === | ||
{{ | {{Основная статья|Липиды}} | ||
[[Файл:Fat triglyceride shorthand formula.svg|thumbnail|left|150px|Схема строения триглицерида: молекула глицерина, к которой прикреплены три молекулы жирных кислот]] | |||
'''[[Липиды]]''' (жиры), как правило составлены из молекулы [[глицерин]]а, к которой сложно-эфирной связью крепятся от одной (моноглицериды) до трёх ([[триглицериды]]) [[карбоновые кислоты|жирных кислот]]. Жирные кислоты делятся на группы по длине углеводородной цепочки и по степени насыщенности (наличия и количества двойных связей в цепочке). Липиды служат у животных одними из основных энергоёмких молекул. Кроме того у них есть различные функции, связанные с передачей клеточных сигналов и переноса липофильных молекул<ref name=Nelson_Cox>{{книга | |||
|заглавие=Lehninger Principles of Biochemistry | |||
|издание=5th | |||
|издательство={{Нп3|W. H. Freeman and Company|W. H. Freeman|en|W. H. Freeman and Company}} | |||
|год=2008 | |||
|isbn=978-0-7167-7108-1 | |||
|язык=en | |||
|автор=Nelson D.L., Cox M.M. | |||
}}</ref>. | |||
{{ | === Белки === | ||
{{Основная статья|Белки}} | |||
[[Файл:AminoAcidball.svg|thumbnail|160px|Схематическая структура α-аминокислоты. [[амины|аминовая]] группа слева, [[Карбоксильная группа|а карбоксильная группа]] справа]] | |||
[[Белки]] как правило являются крупными молекулами — макробиополимерами. Их мономерами являются аминокислоты. Большинство организмов синтезируют белки из 20 разных типов аминокислот. Аминокислоты отличаются друг от друга заместителем в α-положении, строение которого имеет большое значение в свёртывании белка в трёхмерную структуру. Аминокислоты образуют между собой [[пептидная связь|пептидные связи]] выстраивая при этом цепочку — полипептид. Сравнение последовательности аминокислот в белках позволяет биохимикам определить степень гомологичности двух (или более) белков<ref>Общая биология. Учебник для 9 — 10 классов средней школы. Под ред. Ю. И. Полянского. Изд. 17-е, перераб. — М.: Просвещение, 1987. — 288 с.</ref>. | |||
=== | Функции белков в [[клетка]]х живых организмов более разнообразны, чем функции других [[биополимеры|биополимеров]] — [[полисахарид]]ов и [[Нуклеиновые кислоты|нуклеиновых кислот]]. Так, белки-[[ферменты]] катализируют протекание биохимических реакций и играют важную роль в обмене веществ. Некоторые белки выполняют структурную или механическую функцию, образуя [[цитоскелет]], поддерживающий форму клеток. Также белки играют ключевую роль в [[Передача сигнала (биология)|сигнальных системах клеток]], при [[Иммунитет (биология)|иммунном ответе]] и в [[клеточный цикл|клеточном цикле]]. Многие белки, как ферменты так и структуральные белки, создают комплексы с небелковыми биомолекулами. Комплексы с олигосахаридами называются (в зависимости от сравнительной доли белка и полисахарида в комплексе) гликопротеинами или протеогликанами. Комплексы с липидами называются липопротеинами<ref name="несмеяновы 2">{{cite web|url=http://www.ximicat.com/ebook.php?file=nesmeanov1_org.djvu&page=221|title=Начала органической химии. Книга вторая|author=А. Н. Несмеянов, Н. А. Несмеянов|pages=221|access-date=2012-12-26|archive-url=https://www.webcitation.org/6DDe1lJ6m?url=http://www.ximicat.com/ebook.php?file=nesmeanov1_org.djvu|archive-date=2012-12-27|url-status=live}}</ref>. | ||
=== | === Нуклеиновые кислоты === | ||
{{ | [[Файл:DNA chemical structure.svg|thumbnail|200px|right|Структура [[Дезоксирибонуклеиновая кислота|Дезоксирибонуклеиновой кислоты]] (DNA), соединение мономеров]] | ||
[[Нуклеиновые кислоты|Нуклеиновая кислота]] — это комплекс макромолекул, состоящий из полинуклеотидных цепочек. Основная функция нуклеиновых кислот это хранение и кодирование генетической информации. Нуклеиновая кислота синтезируется из макроэргических мононуклеозидтрифосфатов (АТФ, ГТФ, ТТФ, ЦТФ, УТФ), один из которых [[аденозинтрифосфат]] (АТФ), является также основной энергоёмкой молекулой всех живых организмов. Самыми распространёнными нуклеиновыми кислотами являются [[дезоксирибонуклеиновая кислота]] (ДНК) и [[рибонуклеиновая кислота]] (РНК). Нуклеиновые кислоты можно обнаружить во всех живых клетках от [[археи|архей]] до [[эукариоты|эукариотов]], а также в [[вирусы|вирусах]]{{sfn|Collier|1998|pp=96—99}}. | |||
Название «нуклеиновые кислоты» было дано этой группе биополимеров из-за их основного местонахождения — в клеточном ядре. Мономеры этих молекул называются [[нуклеотиды]]. Нуклеотиды состоят из трёх компонентов: азотистого основания ([[аденин]], [[гуанин]], [[цитозин]] присутствуют как в ДНК, так и в РНК, [[тимин]] — только в ДНК, [[урацил]]— только в РНК), моносахарида ([[Рибоза|рибозы]] в РНК или [[Дезоксирибоза|дезоксирибозы]] в ДНК) и остатка [[Ортофосфорная кислота|фосфорной кислоты]]{{sfn|Tropp|2012|pp=5–9}}. | |||
==== | == См. также == | ||
* [[Квантовая биохимия]] | |||
* [[Медицинская биохимия]] | |||
* [[Биохимик]] | |||
* [[Биохимия пива]] | |||
==== | == Примечания == | ||
{{примечания|2}} | |||
==== | == Литература == | ||
# | * ''Марри Р.'' Биохимия человека. / Р. Марри и др. — М., 1993. | ||
* Введение в биохимическую экологию. — М.: [[Издательство Московского университета]], 1986. | |||
* {{книга |заглавие=Essentials of Biochemistry |ссылка=https://archive.org/details/essentialsofbioc0000from |год=2012 |издательство=[[Springer Science+Business Media|Springer]] |isbn=978-3-642-19623-2 |язык=en |автор=Fromm, Herbert J.; Hargrove, Mark}} | |||
* {{книга |заглавие=Vital Forces: The Discovery of the Molecular Basis of Life |ссылка=https://archive.org/details/vitalforcesdisco0000hunt |год=2000 |издательство=[[Academic Press]] |isbn=978-0-12-361811-5 |язык=en |автор=Hunter, Graeme K.}} | |||
* {{книга|автор=Tropp, Burton E.|заглавие=Molecular Biology|ссылка=https://archive.org/details/molecularbiology0000trop_u7j9|издание=4th|год=2012|издательство=Jones & Bartlett Learning|isbn=978-1-4496-0091-4|ref=Tropp}} | |||
* {{книга|автор=Damodaran M. Vasudevan, et al.|заглавие=Textbook of Biochemistry for Medical Students|издание=7th|год=2013|издательство=JP Medical Publishers|ссылка=https://books.google.co.il/books?id=nQz8AAAAQBAJ&printsec=frontcover&dq=biochemistry+textbook&hl=iw&sa=X&ei=k59oVLODDY7Vao_rgOgG&redir_esc=y#v=onepage&q=biochemistry%20textbook&f=false|isbn=978-9-3509-0530-2|ref=Vasudevan}} | |||
* {{книга|автор=Leslie Collier, Balows, Albert, Sussman, Max|заглавие=Topley and Wilson’s Microbiology and Microbial Infections|издательство=[[Elsevier|Virology]]|год=1998|страниц=|ref=Collier|isbn=0-340-66316-2|издание=9th ed.|том=1|ответственный=Mahy, Brian and Collier, Leslie. Arnold}} | |||
* {{книга|автор=[[Северин, Евгений Сергеевич|Северин, Е. С.]]|заглавие=Биохимия: Учеб. для вузов|место=М.|издательство=[[ГЭОТАР-Медиа]]|год=2003|страниц=779|ref=Северин|isbn=5-9231-0254-4|ответственный=Под ред. Е.С. Северина}} | |||
* {{книга|автор=[[Берёзов, Темирболат Темболатович|Березов Т. Т.]], [[Коровкин, Борис Фёдорович|Коровкин Б. Ф.]]|заглавие=Биологическая химия: Учебник|издательство=[[Медицина (издательство)|Медицина]]|год=1998|страниц=704|ref=Березов|isbn=5-225-02709-1|место=М.|издание=3-е изд}} | |||
* {{книга|автор=Николаев А. Я.|заглавие=Биологическая химия|издательство=[[Высшая школа (издательство)|Высшая школа]] |год=1989 |страниц=495 |ref=Николаев |isbn=5-06-001400-2 |Место=М. |тираж=50000}} | |||
==== | == Ссылки == | ||
# | {{Родственные проекты|Тема=Биохимия|Портал=Химия|Викисловарь=биохимия}} | ||
* [https://web.archive.org/web/20070728025743/http://www.ximia.org/biochem/default.htm Ян Кольман, Клаус-Генрих Рем, Юрген Вирт Наглядная биохимия] | |||
* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=stryer.TOC&depth=10 Berg et al. Biochemistry] | |||
* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=mcb.TOC Lodish et al. Molecular Cell Biology] | |||
* [https://www.youtube.com/channel/UCi1gHVkNbwXJjNPuFJHNMZA/featured Видеолекции по Биохимии] | |||
* [http://med-edu.ru/biohim/ Видеоматериалы по Биохимии] | |||
* {{книга |автор=Gerhard Michal, Dietmar Schombur |заглавие=Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology |ответственный= |ссылка=http://www.google.com/books?id=BBS9jOoo9XcC&ots=juR6BXJu8V&sig=gqmL1ZyZASby2LMWDM0qW3Gihn8&redir_esc=y#v=onepage&f=false |место=Hoboken, New Jersey |издательство=Wiley |год=2012 |страниц=401 |isbn=9780470146842}} | |||
* {{cite web |url=https://nauka.tass.ru/tag/biochemistry |title=Биохимия |subtitle=Рубрика «Наука» |publisher=[[ТАСС]] |description=Читать все последние новости на тему |access-date=2023-08-07 }} | |||
{{Внешние ссылки}} | |||
{{ | {{Разделы биологии}} | ||
{{Биохимические группы}} | |||
{{Добротная статья|Биохимия}} | |||
| | |||
}} | |||
[[Категория:Биохимия| ]] | |||
Текущая версия от 08:37, 3 октября 2025
Ошибка скрипта: Модуля «hatnote» не существует.{{#if: | }} Биохи́мия (биологи́ческая, или физиологи́ческая хи́мия, хими́ческая биоло́гия) — наука о химическом составе живых клеток и организмов, а также о лежащих в основе их жизнедеятельности химических процессах. Термин «биохимия» эпизодически употреблялся с середины XIX века, в классическом смысле он был предложен и введён в научную среду в 1903 году немецким химиком Карлом НейбергомШаблон:Sfn.
Биохимия — сравнительно молодая наука, которая находится на стыке биологии и химииШаблон:Sfn.
История развития
Как самостоятельная наука биохимия сформировалась примерно 100 лет назад, однако биохимические процессы люди использовали ещё в глубокой древности, не подозревая, разумеется, об их истинной сущности. В самые отдалённые времена уже была известна технология таких основанных на биохимических процессах производств, как хлебопечение, сыроварение, виноделие, выделка кож. Необходимость борьбы с болезнями заставляла задумываться о превращениях веществ в организме, искать объяснения целебным свойствам лекарственных растений. Использование растений в пищу, для изготовления красок и тканей также приводило к попыткам понять свойства веществ растительного происхождения. Древние мыслители рассуждали о том, какую роль играют воздух и пища в жизнеобеспечении живых существ, о том что вызывает процесс брожения<ref>Зубаиров Д. М. Вехи истории первой кафедры медицинской химии и физики в России (2007) Шаблон:Wayback</ref>.
Персидский учёный и врач X века Авиценна в своей книге «Канон врачебной науки» подробно описал многие лекарственные вещества<ref>Авиценна «Канон врачебной науки» [1] Шаблон:Wayback</ref>.
В XVII веке ван Гельмонт ввёл в обиход термин фермент для обозначения химического реагента участвующего в процессе пищеварения<ref>Шаблон:Книга</ref>.
XVIII век ознаменовался трудами М. В. Ломоносова и А. Л. Лавуазье. На основе открытого ими закона сохранения массы веществ и накопленных к концу столетия экспериментальных данных, была объяснена сущность дыхания и исключительная роль в этом процессе кислородаШаблон:Sfn.
Изучение химии жизни уже в 1827 г. привело к принятому до сих пор разделению биологических молекул на белки, жиры и углеводы. Автором этой классификации был английский химик и врач Уильям Праут<ref>William Prout</ref>. В 1828 году немецкий химик Ф. Вёлер синтезировал мочевину: сначала — из циановой кислоты и аммиака (выпариванием раствора образующегося цианата аммония), а позже в этом же году — из углекислого газа и аммиака. Тем самым впервые было доказано, что химические вещества живого организма могут быть синтезированы искусственно, вне организма. Работы Вёлера нанесли первый удар по теориям представителей школы виталистов, предполагавших присутствие во всех органических соединениях некой «жизненной силы»Шаблон:Sfn. Последующими мощными толчками в этом направлении химии явились лабораторные синтезы липидов (в 1854 году — М. Бертло, Франция) и углеводов из формальдегида (1861 — А. М. Бутлеров, Россия). Бутлеровым была также разработана теория строения органических соединений<ref>Шаблон:Статья</ref>.
Новый толчок развитию биологической химии дали работы по изучению брожения, инициированные Луи Пастером. В 1897 г. Эдуард Бухнер доказал, что ферментация сахара может происходить в присутствии бесклеточного дрожжевого экстракта, и это процесс не столько биологический, сколько химическийШаблон:Sfn. На рубеже XIX и XX веков немецкий биохимик Э. Фишер сформулировал основные положения пептидной теории строения белков, установил структуру и свойства почти всех входящих в их состав аминокислот. Но лишь в 1926 г. Джеймсу Самнеру удалось получить первый чистый фермент, уреазу, и доказать, что фермент — это белок<ref>Шаблон:Cite web</ref>.
Биохимия стала первой биологической дисциплиной с развитым математическим аппаратом благодаря работам Холдейна, Михаэлиса, Ментен и других биохимиков, создавших ферментативную кинетику, основным законом которой является уравнение Михаэлиса-Ментен<ref name="chen10">Шаблон:Статья</ref>.
В 1928 г Фредерик Гриффит впервые показал, что экстракт убитых нагреванием болезнетворных бактерий может передавать признак патогенности не опасным бактериям. Исследование трансформации бактерий в дальнейшем привело к очистке болезнетворного агента, которым, вопреки ожиданиям, оказался не белок, а нуклеиновая кислота. Сама по себе нуклеиновая кислота не опасна, она лишь переносит гены, определяющие патогенность и другие свойства микроорганизма. В 1953 году американский биолог Дж. Уотсон и английский физик Ф. Крик опираясь на работы М. Уилкинса и Р. Франклин описали структуру ДНК — ключ к пониманию принципов передачи наследственной информации. Это открытие означало рождение нового направления науки — молекулярной биологии<ref>Шаблон:Статья</ref>.
В 1958 Джордж Бидл и Эдуард Тейтем получили Нобелевскую премию за работу проведённую на грибах, выводом которой стала гипотеза «один ген — один фермент»<ref>Шаблон:Статья[2] Шаблон:Wayback</ref>. В 1988 Колин Питчфорк стал первым человеком, осуждённым за убийство на основе доказательств, полученных в результате ДНК-дактилоскопии доказательств, и первым преступником, пойманным в результате массового применения процедуры дактилоскопии<ref name="Butler 2009">Шаблон:Книга</ref>. Из последних вех в развитии биохимии следует отметить получение Эндрю Файером и Крейгом Мелло Нобелевской премии по физиологии и медицине за «открытие РНК-интерференции — эффекта гашения активности определённых генов»<ref>Andrew Fire, Siqun Xu, Mary K. Montgomery, Steven A. Kostas, Samuel E. Driver und Craig C. Mello: Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. In: Nature. Band 391, 1998, S. 806—811, PMID 9486653 PDF Шаблон:Webarchive</ref><ref name="Sen 2007">Шаблон:Статья</ref>, а также технология редактирования генома с помощью Crisp/Cas9 метода.
Смежные дисциплины
Возникнув как наука о химии жизни в конце XIX векаШаблон:Sfn, чему предшествовало бурное развитие органической химии, биохимия отличается от органической химии тем, что исследует только те вещества и химические реакции, которые имеют место в живых организмах, прежде всего в живой клетке. Согласно этому определению, биохимия охватывает также многие области клеточной биологии и включает в себя молекулярную биологию<ref>Р. Марри и др. Биохимия человека. Т. 1. — М., 1993. — с. 10.</ref>. После выделения последней в особую дисциплину, размежевание между биохимией и молекулярной биологией в основном сформировалось как методологическое и по предмету исследования. Молекулярные биологи преимущественно работают с нуклеиновыми кислотами, изучая их структуру и функции, в то время как биохимики сосредоточились на белках, в особенности на ферментах, катализирующих биохимические реакции. В последние годы термины «биохимия» и «молекулярная биология» часто используются как синонимыШаблон:Sfn.
Разделы биохимии
- Статическая биохимия (Биоорганическая химия) — наука о химическом составе организмов и структур составляющих их молекул (белков, аминокислот, нуклеиновых кислот, нуклеотидов, углеводов и их производных, липидов, витаминов, гормонов). Её основные объекты — биополимеры, превращения которых составляют химическую сущность биологических процессов, и биорегуляторы, которые химически регулируют обмен веществ.
- Биохимия аминокислот — наука о химическом составе аминокислот<ref>Майстер А. Биохимия аминокислот : [монография] / Под ред. и с предисл.: А. Е. Браунштейн; пер. с англ.: Г. Я. Виленкина — М.: Иностр. лит., 1961 . — 530 с.</ref>.
- Биохимия белков — наука о химическом составе белков<ref>Синютина С. Е. Биохимия белков и ферментов. — Тамбов: ТГУ им. Г. Р. Державина, 2010.</ref>.
- Биохимия ферментов — наука о химическом составе ферментов<ref>Химия и биохимия ферментов: [Сб. статей]. — К.: Наук. думка, 1981. — 90 с.: ил.; 26 см. — (Биохимия животных и человека : Респ. межвед. сб. / АН УССР, Ин-т биохимии им. А. В. Палладина; Вып. 5).</ref>.
- Биохимия углеводов — наука о химическом составе углеводов<ref>Химия и биохимия углеводов: Учеб. пособие. — Владивосток : Изд-во ДВГАЭУ, 1999. — 56 с.</ref>.
- Биохимия нуклеиновых кислот — наука о химическом составе нуклеиновых кислот<ref>Дэвидсон Дж. Биохимия нуклеиновых кислот / Пер. с англ. к. ф.-м. н. В. В. Борисова; Под ред. и с предисл. А. А. Баева. — М.: Мир, 1976. — 412 с.</ref><ref>Терентьева Н. А. Химия и биохимия нуклеиновых кислот: учебное пособие. — Владивосток: Дальнаука, 2011. — 268 с.</ref>.
- Биохимия нуклеотидов — наука о химическом составе нуклеотидов<ref>Степаненко Б.Н. Химия и биохимия углеводов (полисахариды): Учеб. пособие для вузов. — М.: Высш. Школа, 1978. — 256 с.</ref><ref>Соболев А. С. Радиационная биохимия циклических нуклеотидов. — М.: Энергоатомиздат, 1987. — 100 с.</ref>.
- Биохимия липидов — наука о действии липидов, их биологических эффектах, биохимических нарушениях при недостатке или избытке в организме<ref>Препаративная биохимия липидов / [Л. Д. Бергельсон, Э. В. Дятловицкая, Ю. Г. Молотковский и др.; Отв. ред. Л. Д. Бергельсон, Э. В. Дятловицкая]. — М.: Наука, 1981. — 259 с.</ref>.
- Биохимия витаминов — наука о действии витаминов, их биологических эффектах, биохимических нарушениях при недостатке или избытке в организме<ref>Иваненко Е. Ф. Биохимия витаминов: [Учеб. пособие для биол. специальностей вузов]. — К.: Вища школа, 1970. — 210 с.</ref><ref>Биохимия витаминов : учебно-методическое пособие для студентов / А. И. Конопля, Н. А. Быстрова. Курск: КГМУ, 2012.</ref>.
- Биохимия гормонов — наука о действии гормонов, их биологических эффектах, биохимических нарушениях при недостатке или избытке в организме<ref>Биохимия гормонов и гормональной регуляции: монография / [С. А. Афиногенова, А. А. Булатов, В. Н. Гончарова и др.; Отв. ред. акад. Н. А. Юдаев]. — М.: Наука, 1976. — 379 с.</ref><ref>Шушкевич Н. И. Биохимия гормонов : учебное пособие по медицинской биохимии. — Владимир: Изд-во ВлГУ, 2009. — 67 с.</ref>.
- Динамическая биохимия — изучает химические реакции, представляющие обмен веществ (метаболизм), а именно пути превращения молекул и механизмы происходящих между ними реакций<ref>Гофман Э. Г. Динамическая биохимия / Пер. с нем. канд. мед. наук А. И. Арчакова и канд. мед. наук В. М. Девиченского; Под ред. и с предисл. д-ра мед. наук проф. Л. Ф. Панченко. — М.: Медицина, 1971. — 311 с.</ref><ref>Динамическая биохимия: учебное пособие / [В. Е. Толпекин и др.]. — М.: Изд-во МАИ-Принт, 2011. — 71 с.</ref>.
- Молекулярная биология — наука, ставящая своей задачей познание природы явлений жизнедеятельности путём изучения биологических объектов и систем на уровне, приближающемся к молекулярному, а в ряде случаев и достигающем этого предела.
- Биоэнергетика — раздел динамической биохимии, который изучает закономерности образования, аккумуляции и потребления энергии в биологических системах.
- Функциональная биохимия — раздел биохимии, изучающий химические превращения, лежащие в основе функций органов, тканей и организма в целом<ref>Гомазков О. А. Функциональная биохимия регуляторных пептидов: монография. — М.: Наука, 1992. — 159, [1] с.</ref>.
- Биохимия микроорганизмов (Биохимия бактерий) — наука о составе и превращениях веществ в микроорганизмах<ref>Неверова О. А. Биохимия микроорганизмов: учебное пособие: для студентов вузов / О. А. Неверова; Федер. агентство по образованию, Кемер. технол. ин-т пищевой пром-ти. — Кемерово: КемТИПП, 2005. — 83 с.</ref>.
- Биохимия растений — наука о молекулярных процессах, происходящие в растительном организме <ref>Клетович В. Л. Биохимия растений: Учебник. 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Высшая школа, 1986. — 503 с.</ref><ref>Шаблон:Cite web</ref>.
- Биохимия животных — наука о молекулярных процессах, протекающих в клетках живых организмов<ref>Рогожин В. В. Биохимия животных: Учебник. — СПб.: ГИОРД, 2009. — 552 с: ил. ISBN 978-5-98879-074-7</ref>.
- Биохимия человека — это раздел биохимии, который изучает закономерности обмена веществ в человеческом организме<ref>Биохимия человека: [Учеб.]: В 2 тт. / Р. Марри, Д. Греннер, П. Мейес, В. Родуэлл; Пер. с англ. к. ф.-м. н. В. В. Борисова и Е. В. Дайниченко Под ред. д. х. н. Л. М. Гинодмана. — М. : Мир, 2004.</ref>.
- Биохимия крови — наука о закономерностях обмена веществ в крови человека<ref>Наточин Ю. В. Биохимия крови и диагностика / Клинич. б-ца РАМН. — СПб. : Б. и., 1993. — 149 с.</ref><ref>Барышева Е. С. Биохимия крови : лабораторный практикум/ Барышева Е. С., Бурова К. М. — Электрон. текстовые данные. — Оренбург: Оренбургский государственный университет, ЭБС АСВ, 2013. — 141 c.</ref>.
- Биохимия тканей — наука о закономерностях обмена веществ в тканях человека<ref>Языкова М. Ю. Биохимия тканей: учебное пособие для студентов, обучающихся по биологическим специальностям / М. Ю. Языкова. — Самара: Самарский университет, 2004. — 75 с.</ref>.
- Биохимия органов — наука о закономерностях обмена веществ в органах человека.
- Медицинская биохимия — это раздел биохимии, который изучает закономерности обмена веществ в человеческом организме при заболеваниях<ref>Солвей Дж. Г. Наглядная медицинская биохимия: [учеб. пособие] / пер. с англ. А. П. Вабищевич, О. Г. Терещенко; под ред. Е. С. Северина. — 3-е изд., перераб. и доп. — М.: ГЭОТАР-Медиа, 2015. — 168 с. ISBN 978-5-9704-2037-9</ref>.
- Биохимия мышечной деятельности — это раздел биохимии, который изучает закономерности обмена веществ в человеческом организме при мышечной деятельности<ref>Калинский М. И. Биохимия мышечной деятельности. — К.: Здоровья, 1989. — 143 с.</ref><ref>Биохимия мышечной деятельности: Учеб. для студентов вузов физ. воспитания и спорта / Н. И. Волков, Э. Н. Несен, А. А. Осипенко, С. Н. Корсун. — К.: Олимп. лит., 2000. — 502,[1] с.</ref><ref>Мохан Р. Биохимия мышечной деятельности и физической тренировки / Рон Мохан, Майкл Глессон, Пауль Л. Гринхафф; [Пер. с англ. Валерий Смульский]. — К.: Олимп. лит., 2001. — 295 с.</ref>.
- Биохимия спорта — наука, выявляющая закономерности обмена веществ в человеческом организме при предельной по объёму и/или интенсивности мышечной деятельности<ref>Яковлев Н. Н. Биохимия спорта. — М.: Физкультура и спорт, 1974. — 288 с.</ref><ref>Михайлов С. С. Спортивная биохимия: учебник / С. С. Михайлов. — 6-е изд., стер. — М.: Советский спорт, 2010. — 347 с.</ref><ref>Михайлов С. С. Биохимия двигательной деятельности: учебник / С. С. Михайлов. — М.: Спорт, 2016. — 292 с.</ref>.
Методы изучения
В основе биохимической методологии лежит фракционирование, анализ, изучение структуры и свойств отдельных компонентов живого вещества. Методы биохимии преимущественно формировались в XX веке; наиболее распространёнными являются хроматография, открытая М. С. Цветом 21 марта 1903 г.Шаблон:Sfn, центрифугирование (Т. Сведберг, 1923 г., Нобелевская премия по химии 1926 г.) и электрофорез (А. Тизелиус, 1937 г., Нобелевская премия по химии 1948 г.)Шаблон:Sfn<ref name="Laberge" />. Важным экспериментальным способом, позволяющим на атомарном уровне установить трехмерную структуру белка, является рентгеноструктурный, или кристаллографический, анализ, позволяющий определить пространственные координаты всех атомов исследуемого объекта. Впервые он был применен Джоном Кендрью и Максом Перутцом для исследования гемоглобина и миоглобина<ref>Шаблон:Cite pmid</ref><ref>Шаблон:Cite pmid</ref>. Розалинд Франклин, успешная ученая-рентгенограф, совершенствовавшая технику микросъемки и добившаяся удивительных по четкости рентгенограмм молекул, способствовала открытию двойной спирали ДНК Джеймсом Уотсоном и Фрэнсисом Криком<ref>Шаблон:Статья</ref>.
С конца XX в. в биохимии всё шире применяются методы молекулярной и клеточной биологии, в особенности искусственная экспрессия и нокаут генов в модельных клетках и целых организмах (см. генная инженерия, биотехнология). Определение структуры всей геномной ДНК человека выявило приблизительно столько же ранее неизвестных генов и их неизученных продуктов, сколько уже было известно к началу XXI века благодаря полувековым усилиям научного сообщества. Оказалось, что традиционный химический анализ и очистка ферментов из биомассы позволяют получить лишь те белки, которые в биогенных веществах присутствуют в сравнительно большом количестве. Не случайно основная масса ферментов была открыта биохимиками в середине XX века и к концу столетия распространилось убеждение, что все ферменты уже открыты. Данные геномики опровергли эти представления, но дальнейшее развитие биохимии требовало изменения методологии. Искусственая экспрессия ранее неизвестных генов предоставила биохимикам новый материал для исследования, часто недоступный традиционными методами. В результате возник новый подход к планированию биохимического исследования, который получил название обратная генетика или функциональная геномика<ref>Koonin E., Galperin M. Sequence — Evolution — Function.</ref>. В последние десятилетия большое развитие произошло в области компьютерного моделирования. Эта методика позволяет исследовать свойства биомолекул там, где невозможно (или очень затруднительно) провести прямой эксперимент. Методика основана на компьютерных программах, которые позволяют визуализировать структуру биомолекул, задать их предполагаемые свойства и наблюдать результирующие взаимодействия между молекулами, такие например как энзим — субстрат, энзим — коэнзим, энзим — ингибитор<ref name = "Laberge">Шаблон:Книга</ref>.
Необходимые химические элементы
Ошибка скрипта: Модуля «Основная статья» не существует. Из 90 химических элементов, встречающихся в естественном состоянии в природе, для поддержания жизни необходимо чуть больше четверти. Большинство редких элементов не являются необходимыми для поддержания жизни (исключениями являются селен и иод). Большинством живых организмов не используются также два распространённых элемента, алюминий и титан. Списки необходимых для живых организмов элементов различаются на уровне высших таксонов. Всем животным необходим натрий, но некоторые растения обходятся без него. Растениям необходим бор и кремний, а животным — нет (или необходим в ультрамикроскопических количествах). Всего шесть элементов (так называемые макронутриенты, или органогенные элементы) составляют до 99% от массы человеческого организма. Это углерод, водород, азот, кислород, кальций и фосфор. Кроме этих шести основных элементов, человеку необходимы малые или микроскопические количества ещё 19 элементов: натрий, хлор, калий, магний, сера, железо, фтор, цинк, кремний, медь, иод, бор, селен, никель, хром, марганец, молибден, кобальт<ref>Ultratrace minerals. Authors: Nielsen, Forrest H. USDA, ARS Source: Modern nutrition in health and disease / editors, Maurice E. Shils … et al.. Baltimore : Williams & Wilkins, c1999., p. 283-303. Issue Date: 1999 URI: [3] Шаблон:Wayback</ref> и, как показано в 2014 году, бром<ref name="pmid24906154">Шаблон:Статья</ref>.
Биомолекулы
Четыре основных типа молекул, исследованием которых занимается биохимия — это углеводы, липиды, белки и нуклеиновые кислоты, а также их гибриды, протеогликаны, гликопротеины, липопротеины и т. п. Многие биомолекулы являются полимерами (макромолекулами), строительными «блоками» которых являются более простые биомолекулы. Например, полисахариды состоят из простых сахаров, белки из аминокислот, нуклеиновые кислоты из мононуклеотидов. Биологические полимеры часто составляют комплексы, строение которых неразрывно связано с их биологической функцией<ref name = "Laberge2">Шаблон:Книга</ref>. В иерархии химической сложности живых систем макромолекулы стоят выше химических элементов, функциональных групп и простых биомолекул, а на следующих ступенях этой иерархии — метаболические пути, клетка, многоклеточные организмы и экосистемы<ref>Новая медицинская энциклопедия Биохимия Шаблон:Wayback</ref>.
Углеводы
Ошибка скрипта: Модуля «Основная статья» не существует.
Простые углеводы или моносахариды, как например глюкоза (C6H12O6), фруктоза (C6H12O6)<ref name=Whiting1970>Шаблон:Книга</ref>, и дезоксирибоза (C5H10O4) могут служить мономерами более сложных. Так во время синтеза молекулы дисахарида соединяются две молекулы моносахаридов и выделяется молекула воды. Полисахариды служат для аккумуляции энергии (крахмал у растений, гликоген у животных), а также как структурообразующие молекулы (например основным компонентом клеточных стенок растений является полисахарид целлюлоза, а хитин является структурным полисахаридом низших растений, грибов и беспозвоночных животных (в основном роговых оболочек членистоногих — насекомых и ракообразных)<ref name="Бауков">Шаблон:Книга</ref>.
Липиды
Ошибка скрипта: Модуля «Основная статья» не существует.
Липиды (жиры), как правило составлены из молекулы глицерина, к которой сложно-эфирной связью крепятся от одной (моноглицериды) до трёх (триглицериды) жирных кислот. Жирные кислоты делятся на группы по длине углеводородной цепочки и по степени насыщенности (наличия и количества двойных связей в цепочке). Липиды служат у животных одними из основных энергоёмких молекул. Кроме того у них есть различные функции, связанные с передачей клеточных сигналов и переноса липофильных молекул<ref name=Nelson_Cox>Шаблон:Книга</ref>.
Белки
Ошибка скрипта: Модуля «Основная статья» не существует.
Белки как правило являются крупными молекулами — макробиополимерами. Их мономерами являются аминокислоты. Большинство организмов синтезируют белки из 20 разных типов аминокислот. Аминокислоты отличаются друг от друга заместителем в α-положении, строение которого имеет большое значение в свёртывании белка в трёхмерную структуру. Аминокислоты образуют между собой пептидные связи выстраивая при этом цепочку — полипептид. Сравнение последовательности аминокислот в белках позволяет биохимикам определить степень гомологичности двух (или более) белков<ref>Общая биология. Учебник для 9 — 10 классов средней школы. Под ред. Ю. И. Полянского. Изд. 17-е, перераб. — М.: Просвещение, 1987. — 288 с.</ref>.
Функции белков в клетках живых организмов более разнообразны, чем функции других биополимеров — полисахаридов и нуклеиновых кислот. Так, белки-ферменты катализируют протекание биохимических реакций и играют важную роль в обмене веществ. Некоторые белки выполняют структурную или механическую функцию, образуя цитоскелет, поддерживающий форму клеток. Также белки играют ключевую роль в сигнальных системах клеток, при иммунном ответе и в клеточном цикле. Многие белки, как ферменты так и структуральные белки, создают комплексы с небелковыми биомолекулами. Комплексы с олигосахаридами называются (в зависимости от сравнительной доли белка и полисахарида в комплексе) гликопротеинами или протеогликанами. Комплексы с липидами называются липопротеинами<ref name="несмеяновы 2">Шаблон:Cite web</ref>.
Нуклеиновые кислоты
Нуклеиновая кислота — это комплекс макромолекул, состоящий из полинуклеотидных цепочек. Основная функция нуклеиновых кислот это хранение и кодирование генетической информации. Нуклеиновая кислота синтезируется из макроэргических мононуклеозидтрифосфатов (АТФ, ГТФ, ТТФ, ЦТФ, УТФ), один из которых аденозинтрифосфат (АТФ), является также основной энергоёмкой молекулой всех живых организмов. Самыми распространёнными нуклеиновыми кислотами являются дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) и рибонуклеиновая кислота (РНК). Нуклеиновые кислоты можно обнаружить во всех живых клетках от архей до эукариотов, а также в вирусахШаблон:Sfn.
Название «нуклеиновые кислоты» было дано этой группе биополимеров из-за их основного местонахождения — в клеточном ядре. Мономеры этих молекул называются нуклеотиды. Нуклеотиды состоят из трёх компонентов: азотистого основания (аденин, гуанин, цитозин присутствуют как в ДНК, так и в РНК, тимин — только в ДНК, урацил— только в РНК), моносахарида (рибозы в РНК или дезоксирибозы в ДНК) и остатка фосфорной кислотыШаблон:Sfn.
См. также
Примечания
Литература
- Марри Р. Биохимия человека. / Р. Марри и др. — М., 1993.
- Введение в биохимическую экологию. — М.: Издательство Московского университета, 1986.
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга
Ссылки
- Ян Кольман, Клаус-Генрих Рем, Юрген Вирт Наглядная биохимия
- Berg et al. Biochemistry
- Lodish et al. Molecular Cell Biology
- Видеолекции по Биохимии
- Видеоматериалы по Биохимии
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Cite web
Шаблон:Внешние ссылки Шаблон:Разделы биологии Шаблон:Биохимические группы Шаблон:Добротная статья