Город был основан древними лузитанами и поначалу назывался Эборой. В 80—72 гг. до н. э. служил резиденцией мятежного полководца Сертория. В ознаменование привилегий, дарованных городу Цезарем, он был переименован в Liberalitas Julia. С V века упоминаются местные епископы.
В 712 г. Эвора была завоёвана маврами, которые называли её Жабурой. Для освобождения Эворы первый португальский король основал Ависский орден рыцарей, в распоряжение которого Эвора и была передана после её освобождения от мавров в 1166 году.
В XV и особенно XVI веках, при монархах Ависской династии, Эвора часто служила местом пребывания королевского двора. Это время считается её золотым веком. В 1663—1665 гг. оккупирована испанцами. В 1559—1759 гг. в городе работал университет.
В XVIII веке политическое и экономическое значение Эворы упало. Самым знаменательным событием XIX века была состоявшаяся здесь в 1832 году капитуляция короля Мигеля, завершившая период гражданских войн в Португалии.
Собор Се — в основном построенный между 1280 и 1340 гг. в романо-готическом стиле, это один из самых интересных готических памятников Португалии. Собор имеет портал со статуями Апостолов (приблизительно 1335), красивый неф, в котором расположен алтарь Богоматери с Младенцем, сделанный из позолоченного дерева, а также монастырь. Файл:Evora, Alentejo, Portugal from the cathedral roof, 28 September 2005.jpgВид города с крыши городского собора.
Эвора является центром большой сельскохозяйственной области. В городе находится много предприятий по обработке зерна, винограда, оливок, пробкового дерева и др. Также производится обработка шерсти и производство изделий из неё.